A reduction in algae data errors after LIMS customization

Innowise has implemented and customized a web-based Laboratory Information Management System (LIMS), LabCollector, to efficiently monitor growth and lineage of algae used in animal feed production.

Klient

Region
UE
Klient od
2023

Naszym klientem jest firma specjalizująca się w produkcji pasz dla zwierząt na bazie alg. Szczegółowe informacje o kliencie nie mogą zostać ujawnione zgodnie z warunkami umowy NDA.

Wyzwanie

Potrzeba efektywnego zarządzania i analizowania danych z wielu źródeł

Nasz klient wykorzystał plik Excel z oddzielnymi zakładkami dla każdej próbki glonów do monitorowania gęstości komórek i stężenia azotanów (NO3 mM) w czasie. Kluczowe wzory na wzrost i zużycie składników odżywczych zostały zastosowane do oceny replikacji glonów i poboru składników odżywczych po manipulacji.

Główny problem: Zarządzanie danymi laboratoryjnymi stanowi wyzwanie ze względu na ogromną ilość generowanych danych, złożoność procedur eksperymentalnych oraz potrzebę rygorystycznej organizacji, bezpieczeństwa i dostępności. 

Drugorzędne wyzwania: Brak metody śledzenia ruchu glonów między naczyniami o różnych rozmiarach utrudnia naszemu klientowi odtworzenie linii w przypadku zanieczyszczenia lub zniszczenia kultury. Aby zapewnić, że krytyczne dane, takie jak gęstość komórek i stężenie azotanów, są dokładnie rejestrowane i łatwo dostępne, rozważano system zarządzania informacjami laboratoryjnymi (LIMS), jednak okazał się on zbyt kosztowny i nie był w pełni zgodny z ich specyficznymi procesami.

W obliczu tych wyzwań nasz klient poszukiwał niedrogiego rozwiązania, które zwiększyłoby identyfikowalność i poprawiło wydajność obsługi zanieczyszczeń lub niszczenia kultur.

Rozwiązanie

Wdrażanie i dostosowywanie gotowych systemów LIMS

Uznając potrzebę specjalistycznego rozwiązania do zarządzania informacjami, firma Innowise skorzystała z możliwości wdrożenia i dostosowania gotowego systemu. Podejście to zostało wybrane w celu zaoszczędzenia pieniędzy klienta, ponieważ rozwiązania oparte na platformie są bardziej przystępne cenowo w porównaniu do opracowywania niestandardowego LIMS od podstaw.

Integracja danych i automatyzacja obliczeń podobna do Excela

Zintegrowaliśmy LabCollector i skonfigurowaliśmy moduł próbek tak, aby odzwierciedlał kolumny używane w poprzednich arkuszach Excela. Chociaż LabCollector nie obsługuje dokładnej elastyczności formuł Excela, znaleźliśmy obejście. Nasze rozwiązanie pozwala na ponowne obliczenia i aktualizacje bazy danych bezpośrednio, dostosowując się do obliczeń podobnych do Excela. To dostosowanie upraszcza wprowadzanie danych i zarządzanie nimi, zachowując spójność z istniejącymi formatami. Automatyzuje obliczenia w LabCollector, zwiększając wydajność i minimalizując ręczne zadania związane z danymi.

Funkcja śledzenia pochodzenia

Skonfigurowaliśmy funkcję śledzenia linii w module próbek LabCollector. Funkcja ta umożliwia tworzenie ukierunkowanych wykresów w celu wizualizacji i śledzenia pochodzenia próbek alg w różnych naczyniach lub na różnych etapach eksperymentu. Ułatwia to łatwą identyfikację pochodzenia i ścieżek przemieszczania się próbek, co ma kluczowe znaczenie dla zarządzania i rozwiązywania problemów związanych z zanieczyszczeniem lub zniszczeniem kultury.

Zarządzanie zapasami i aktualizacje partii

Nasz zespół połączył niestandardowy moduł próbek z modułem inwentaryzacji, aby śledzić poszczególne zbiorniki, umożliwiając zarządzanie zapasami. Aby efektywnie zarządzać jednolitym dodawaniem składników odżywczych do wielu zbiorników, wdrożyliśmy funkcję aktualizacji wsadowej w module próbek. Zmniejsza to nakład pracy ręcznej i minimalizuje błędy związane z indywidualnym wprowadzaniem danych, zwiększając wydajność operacyjną w utrzymywaniu kultur alg. 

Migracja danych i autoryzacja

Aby zachować cenne dane z przeszłości i zapewnić ciągłość, dokonaliśmy migracji danych historycznych do nowego systemu. Uwzględniając rygorystyczne standardy organizacyjne, stworzyliśmy solidny system autoryzacji i uprawnień, aby bezpiecznie kontrolować dostęp. Wreszcie, aby płynnie zintegrować się z istniejącymi operacjami, nasz zespół wdrożył rozwiązanie w infrastrukturze klienta (IWS). Podejście to nie tylko pozwoliło zachować kompleksowe odniesienie historyczne, ale także zagwarantowało bezpieczną kontrolę dostępu. 

Technologie

AWS, Docker

Środowisko

Visual Studio Code

Proces

W naszym procesie projektowym wybraliśmy metodologię opartą na frameworku SCRUM the Scrum, aby podzielić proces na możliwe do zarządzania sprinty, pozwalając na ciągłe informacje zwrotne i ulepszenia. Nasz zespół korzystał z Google Meet do skutecznej interakcji w czasie rzeczywistym między członkami zespołu i interesariuszami, dzięki czemu wszyscy byli na bieżąco informowani o postępach projektu. Używaliśmy JIRA jako naszego systemu zarządzania backlogami do śledzenia sprintów, backlogów i zagadnień, zapewniając wysoką organizację i przejrzystość przepływu projektu. 

Ponadto nasz analityk biznesowy zagłębił się we wszystkie procesy klienta, rozumiejąc, jak wszystko było zorganizowane i identyfikując najlepszy sposób na zintegrowanie tych procesów z nowym rozwiązaniem. To zaangażowane podejście pomogło naszemu zespołowi zrealizować projekt dostosowany do potrzeb klienta, zapewniając płynne i wydajne przejście na nowy system.

Zespół

1

Analityk biznesowy

1

Programista PHP

1

Analityk ds. rozwoju baz danych

1

Specjalista ds. dostosowywania platformy

1

Specjalista ds. kontroli jakości

1

Koordynator projektu

1

Inżynier DevOps

Expected results

Naszym celem była optymalizacja wzrostu i zdrowia kultur alg poprzez śledzenie i dostosowywanie składników odżywczych i warunków. Kierując się tym celem, nasz zespół wdrożył LIMS, umożliwiając płynne śledzenie linii glonów i zarządzanie zapasami, jednocześnie dostarczając klientowi opłacalne rozwiązanie.

Wpływ jest widoczny w kilku kluczowych wskaźnikach wydajności:

  • Zwiększona wydajność zespołu: Wcześniej zarządzanie i aktualizowanie danych przechowywanych w plikach Excel w SharePoint stanowiło wyzwanie, zwłaszcza w odniesieniu do jednoczesnych aktualizacji i kontroli wersji. Scentralizowane przechowywanie i zautomatyzowane mechanizmy synchronizacji zapewniają, że wszyscy członkowie zespołu pracują z najbardziej aktualnymi i dokładnymi danymi, eliminując potrzebę ręcznej konsolidacji i zmniejszając ryzyko rozbieżności danych.
  • Ulepszona wizualizacja danych: Znaczącym postępem było wprowadzenie wizualizacji linii, funkcji całkowicie nieobecnej w Excelu. Wizualizacja linii pomaga łatwo zrekonstruować ścieżkę ascendencji (genealogię) każdej algi, zapewniając wgląd w optymalne warunki wzrostu i strategie zarządzania składnikami odżywczymi.
  • Usprawniony proces podejmowania decyzji: Zwiększona widoczność dla zarządu obejmuje kompleksową analizę wskaźników dotyczących alg, co ma kluczowe znaczenie dla podejmowania świadomych decyzji i planowania strategicznego w zakresie optymalizacji produkcji pasz dla zwierząt na bazie alg. To usprawnione podejście napędza innowacje i zrównoważony rozwój w wykorzystywaniu alg do zaawansowanych formuł paszowych.

Strategiczne przyjęcie przez Innowise niestandardowego, gotowego systemu zarządzania informacjami nie tylko spełniło specjalistyczne potrzeby naszego klienta, ale także obniżyło koszty w porównaniu do opracowywania niestandardowego rozwiązania od podstaw. Takie podejście ułatwiło usprawnione zarządzanie danymi i zwiększyło wgląd w wykorzystanie składników odżywczych w różnych szczepach glonów, co ma kluczowe znaczenie dla optymalizacji warunków produkcji pasz dla zwierząt.

Czas trwania projektu
  • Grudzień 2023 r. - luty 2024 r.

20%

wzrost wydajności zespołu

99%

redukcja błędów danych dotyczących glonów

    Skontaktuj się z nami

    Umów się na rozmowę lub wypełnij poniższy formularz, a my odezwiemy się do Ciebie po przetworzeniu Twojego zgłoszenia

    Wyślij nam wiadomość głosową
    Załącz dokumenty
    Prześlij plik

    Można załączyć 1 plik o rozmiarze do 2 MB. Prawidłowe formaty plików: pdf, jpg, jpeg, png.

    Klikając Wyślij, wyrażasz zgodę na przetwarzanie Twoich danych osobowych przez Innowise zgodnie z nasz Polityką Prywatności w celu przekazania Ci odpowiednich informacji. Podając numer telefonu, zgadzasz się na kontakt za pośrednictwem połączeń głosowych, SMS-ów lub komunikatorów. Mogą obowiązywać opłaty za połączenia, wiadomości i transmisję danych.

    Możesz także wysłać swoje zapytanie
    na adres contact@innowise.com
    Co dalej?
    1

    Po otrzymaniu i przetworzeniu zgłoszenia skontaktujemy się z Tobą, aby szczegółowo opisać projekt i podpisać umowę NDA w celu zapewnienia poufności.

    2

    Po zapoznaniu się z Twoimi potrzebami i oczekiwaniami, nasz zespół opracuje projekt wraz z zakresem prac, wielkością zespołu, czasem i szacunkowymi kosztami.

    3

    Zorganizujemy spotkanie w celu omówienia oferty i ustalenia szczegółów.

    4

    Na koniec podpiszemy umowę, błyskawicznie rozpoczynając pracę nad projektem.

    strzałka