Att flytta data från ett EHR-system till ett annat innebär vanligtvis följande steg: planera, extrahera, rensa, mappa, omvandla, utföra och validera. I praktiken innebär det att hämta data, konvertera medicinska data, mappa till det nya schemat och de nya koduppsättningarna, rensa journalerna, flytta dem och validera resultaten. All data hanteras i ett standardiserat format, som HL7 eller FHIR. Om det görs på rätt sätt känns hela processen mer som en kontrollerad överlämning som inte stör vårdflödet.