Het overzetten van gegevens van het ene EPD naar het andere komt meestal neer op de volgende stappen: plannen, extraheren, opschonen, toewijzen, transformeren, uitvoeren en valideren. In de praktijk betekent dit dat gegevens worden opgehaald, medische gegevens worden geconverteerd, toegewezen aan het nieuwe schema en de nieuwe codereeksen, de medische dossiers worden opgeschoond, overgezet en de resultaten worden gevalideerd. Alle gegevens worden verwerkt in een gestandaardiseerd formaat, zoals HL7 of FHIR. Als dit goed wordt gedaan, voelt het hele proces meer als een gecontroleerde overdracht die de zorgstromen niet verstoort.